居家隔離、居家檢疫、自主健康管理等限制人民自由的防疫措施，目的是要保護人民的身心健康，而犧牲一部分人民的人身自由，但機組人員的工作型態不同於一般人，每個月都可能面臨反覆的檢疫，抽離原有的生活圈，其人身自由和身心健康被侵害的程度，是比一般人民更嚴重的。
#兼顧人權的防疫一直是工會的主張，就算是為了防疫的正當性，也應盡量採取對人權侵害最小的方法，然在去年12月，僅因為少部分機組人員的違規案例，指揮中心、民航局即採取全面加嚴的作法，雖有進行滾動式調整，但到現在為止都還諸多不合理規定，更造成大眾認為多數機組人員不遵守防疫規定的錯誤印象。
本會認為，機組人員的檢疫規定，其侵害人權的程度並不符合比例原則，#防疫的決策過程更應該受到檢討與監督，因此決定向監察院與國家人權委員會陳情，請求調查。
